Em resposta a uma carta de Drs. Lieberman e Beale, datada de 5 de março de 2026, referente à identificação de um alelo heterozigoto na posição G966T (ou G969T, conforme numeração de referência de T. pallidum) do gene 16S rRNA de Treponema pallidum subespécie pallidum. Eles levantaram a hipótese de que a identificação do alelo poderia ter sido causada por montagens erradas do genoma ou contaminação com sequências de outras espécies de Treponema.
Reanálise e Resultados
Em resposta às preocupações com a reprodutibilidade, realizamos uma análise separada utilizando um processo analítico independente do nosso trabalho original. Nossa reanálise se concentrou nas bibliotecas de sequenciamento de Beale et al. e aplicou uma abordagem baseada em mapeamento, alinhando as leituras com o gene 16S rRNA do genoma de referência de T. pallidum (NC_021490.2: 231255–232803). A reanálise concluiu que o alelo heterozigoto previamente identificado foi de fato resultado de contaminação.
Correções e Atualizações
Como resultado, a Tabela 4 e o texto associado ao polimorfismo de nucleotídeo único heterozigoto foram removidos do artigo original. Além disso, um parágrafo adicional foi adicionado ao Apêndice, detalhando as análises adicionais.
Conclusão
Essa reanálise resolve as preocupações com a reprodutibilidade e reforça a confiabilidade dos resultados relacionados à resistência à doxiciclina e mutações no 16S rRNA em Treponema pallidum.